Cell | 建立生命体树突状细胞与辅助性T细胞相互作用模型

细胞核-细胞核作用力异常复杂，涵盖大量分子会与频谱通路，学界钻研多年，仍旧是管中窥豹。来自蒙彼利埃PSL科学研究私立大学的Vassili Soumelis团队于在Cell华尔街日报上登载题为A Quantitative Multivariate Model of Human DendriticCell-T Helper Cell Communication的发表文章，成立了物理与理论为基础的科学研究新方法，物理上，在蛋白质水平验证了细胞核所分泌物的细胞核因子与应激反应；理论上，成立了频谱接口密切关系的联系和作用力彼此间。写作者以人类大脑皮质圆锥形细胞核（Dendritic cell，全称DC）与；也T细胞核（T Helper cell，全称Th）密切关系的作用力为科学研究取向，分析了36例DC相关的频谱分子会和17种Th分泌物的细胞核因子，并依靠这些统计数据成立数学模同型，演算出56种已经被物理推测的细胞核相互彼此间，与此同时，还推测出290种可能彼此间，并推测了IL-12p70可以通过IL-1频谱通路诱发17同型；也T细胞核（全称Th17）。首先，写作者采集了人类浆细胞核来源的DC（MoDCs）和外周肝脏CD11c+DC（bDCs）两类细胞核，并诱因24两星期。所换用的诱因频谱主要举例来说三大类多达14种。第一种：内源频谱分子会，有数干扰素beta（interferon β，全称IFN-β），GM-CSF， TSLP和 PGE2；第二种：Toll样抗原的配基，有数Toll4抗原的拮抗剂脂多糖（ lipopolysaccharide，全称LPS），Toll1/2抗原拮抗剂PAM3CSK4，Dectin1拮抗剂Curdlan，Toll2/Dectin1拮抗剂 zymosan，Toll7/8抗原拮抗剂R848，Toll3抗原拮抗剂 poly(I：C) 和NLRP3发炎小纤活化剂铝钾；第三种：细杆菌病毒，有数高温灭活的Candida albicans （全称HKCA），恩斯杆菌（Listeria monocytogenes，全称HKLM），Staphylococcus aureus （全称HKSA）， Streptococcus pneumoniae （全称HKSP）和流感病毒（influenza virus，全称flu）。接原地，写作者通过流式细胞核术等新方法，验证了36种DC相关分子会的传达具纤情况，其中，29种西北面细胞核微小，7种西北面细胞核分泌物上清之中。结果显示，除了一些推断的DC细胞核号召之外，写作者还有了一些原先发现：（1）zymosan诱因的MoDCs 传达上佳的CD54 和PVR；（2）流感病毒诱因的MoDCs可以诱发ICOSL；（3）LPS诱因的MoDCs 可以诱发上佳的CD30L和CD83。再原地，写作者将这些诱因过的DC与T细胞核科学研究生院6天，随后验证Th的转化生产成本以及17种Th相关细胞核因子的传达分泌物具纤情况。寻常的是，写作者将Th和DC的表现相互比起，发现，这二者密切关系并不存在交集的彼此间，也就是说，两种诱因物对DC造成的功效类似，但是，这两种诱因物所处理事件的DC与T细胞核科学研究生院后来，造成的功效很可以截然各不相同。接着，写作者换用蛋白质组学的新方法，以上述物理统计数据成立模同型。简单来说，写作者示范DC可用的36种频谱分子会和Th可用的17种效应分子会，将两两密切关系的彼此间简化为“持续性转录”和“负向转录”两种，并且，还转至统计数据库和已登载文献中的信息，成立了复杂的频谱转录网络平台。例如，通过这一模同型，写作者发现， IL-10的负向转录分子会有数OX40L， 4-1BBL， IL-12， TNF-α， CD58， VISTA，Galectin-3， CD80， CD29， IL-1， ICAM-3， SLAMF3， IL-28a和CD83，而持续性转录分子会有数Jagged-2， PDL1， IL-10， CD11a， HLA-DR， ICOSL， CD100， CD30L， CD18， ICAM-2和CD86，这样，得到DC各不相同的诱因频谱，写作者就可以说明了Th号召细胞核IL-10的传达分泌物具纤情况。最后，写作者利用这样模同型，试图推测并推测原先细胞核相互彼此间。通过成立的模同型，写作者发现，IL-12在与IL-1， ICAM-2或者Jagged-2都由分泌物时，倾向于转录IL-17F，而与CD70， IL-23或者 LIGHT 都由出现时，则更倾向于转录IL-17A。另外，敲除IL-12，IL-17A和IL-17F的传达水平都显着下降。这些结果说明，IL-12参与Th17的诱发并存。为了进一步探讨IL-12诱发Th17的机制，写作者换用纤外诱发Th的模同型，发现，IL-12并不能直接诱发Th17，但是，同时转至IL-1和IL-12，Th17就诱发出来了。这是一篇物理与理论为基础的佳作。物理结果与计算建模相互支持，相互指导，包涵。如下图标明，物理部份换用了密切共同点两部份统计数据，一是何种诱因下DC细胞核的号召，二是号召后的DC对T细胞核的作用。理论部份以DC和T细胞核的可用细胞核因子为基本，成立了细胞核因子密切关系的持续性和负向转录网络平台模同型。通过这一模同型，写作者相符合一些原先细胞核间相互彼此间，最终再用物理推测这些彼此间是否确有。这篇名的；还有有两处，一是成立和物理理论为基础科学研究的独创，二是发表文章中提供的诸多细胞核转录信息以供科学研究概要。原始出处：Grandclaudon M1, Perrot-Dockès M2, Trichot C1, et al.A Quantitative Multivariate Model of Human Dendritic Cell-T Helper Cell Communication.Cell. 2019 Oct 3;179(2):432-447.e21. doi: 10.1016/j.cell.2019.09.012.