Mol Cell:张锋再造三合一组合抗病毒的新型CRISPR Cas13系统会

近日，麻省理工学院和斯坦福大学Broad研究者所传来好消息：Pardis C. Sabeti、张锋等研究者联合开发出一种新的型的持续病态毒的系统。当今上有许多常用的致命病原体都是基于单链RNA的病原，像是埃博拉病原、山后的卡病原和流感病原。该的系统在CRISPR Cas13技术的基础上其后换装，可主要用途测定和摧毁进化核糖体中会具有单链RNA的病原。该研究者发表在《Molecular Cell》杂志上。CRISPR的系统为持续病态毒方法导致曙光在此之前，张锋设计团队的研究者部门凭借着CRISPR/Cas9的系统为筑成免疫的系统抵持续病态毒入侵导致更进一步想。然而，入侵进化的病原更加多变，即使是在同一一亚种内，也能不断适应环境。因此我们并不需要更加灵活的持续性病原平台。为了探索更进一步持续病态毒策略，研究者部门将注视叛离了CRISPR Cas13的系统，Cas13激酶可以天然地类似物细菌中会的病原RNA。它可以对核糖体来进行编程，从病原固体中会转化成特定的核酸多肽。尽管CRISPR Cas13的系统依然实际上一些局限病态，但是该方法在实验室中会更容易操作，并且在此之前张锋设计团队的研究者部门在哺乳动一物核糖体中会已经来进行了充分的实验证明。研究者部门开发了一种名为CARVER的新的型平台，它能将Cas13介导的病原RNA氢化与基于Cas13的较慢病患读数结合起来，使用特定的高灵敏度激酶报告底一物解锁（SHERLOCK）平台，测定瓦解基于RNA的病原。创建三合一的的系统研究者部门首先筛选了350多个进化相关病原（HAV）基因组，以断定Cas13可以适当类似物的病原RNA多肽。他们主要寻找的是既不易突变，又最有可能在切割后禁用病原的片段。病原基因组中会潜在的Cas13前提核糖体斯坦福大学Cameron Sabeti实验室的博士后Myhrvold博士对此：“理论上，你可以编程Cas13来还击病原的任何一小。但是一亚种内部和一亚种之间都有巨大的多样病态，随着病原的演化出，大一小基因组都发生了很快的推移。如果你不小心翼翼，你可能会追求最终并未缺点的前提。”然后，他们通过近似值分析测序数据，以具体数百种病原一亚种中会的数千个潜在核糖体，这些核糖体可能是Cas13的适当靶标。每一次，研究者部门设计了该的系统的Cas13指导RNA。新的编程的Cas13在感染了淋巴核糖体病态脉络膜脑膜炎病原（LCMV）、流感流感病原（IAV）和水泡病态口炎病原（VSV）的进化核糖体中会来进行了实验试验中。将Cas13扩展探头后24小时，研究者部门观察到培养一物中会病原RNA的总体降低了40倍。随后，研究者部门检查了Cas1抑制病原感染病态的能力。研究者数据显示：病原渗透到后八小时，Cas13将流感病原的感染力降低了300倍以上。最后，该设计团队使用SHERLOCK测定技术来实时测算Cas13类似物后的病原RNA总体。该测定的系统获取了有关治果的较慢反馈以及有关特定病原突变的信息。章中对于病原感染的疗法，虽然已经同意了90多种持续病态一物，但它们只能疗法9种疾病。总体而言，只有16种病原具有FDA同意的疫苗。因此，找到行之适当的持续病态毒方法显得尤为重要。该研究者的第一作者 Catherine Freije 对此：“Cas13可以是一种研究者应用软件，来探索进化核糖体中会病原生态学的许多上都，它也可能是一种临床应用软件，主要用途病患样本，疗法病原感染，并衡量疗法的适当病态——所有这些都能让CARVER在更进一步或耐药病态病原出现时很快适应和应对。”更早出处:PFreije CA1, Myhrvold C2, Boehm CK3, et a1.Programmable Inhibition and Detection of RNA Viruses Using Cas13.Mol Cell. 2019 Oct 2. pii: S1097-2765(19)30698-7. doi: 10.1016/j.molcel.2019.09.013. [Epub ahead of print]